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鱼类系统学与生物地理学学科组
作者: | 2009-08-26 | 浏览量:
 


学科带头人:何舜平

学科组成员:学科组:陈宜瑜 院士 研究员;何舜平 研究员;王绪桢 助理研究员;彭作刚 助理研究员 博物馆:何舜平馆长;张鹗 副研究员;谢志才 副研究员;蔡鸣俊 实验师;冯恩慧 实验师

学科组介绍:研究工作运用形态学、分子生物学、个体发育的手段对淡水鱼类开展α、β、γ水平上的分类学研究;使用历史生物地理学的理论和方法研究鱼类分布格局的形成过程。应用生物信息学方法使我所淡水生物标本在新的运行模式下利用和管理。通过野外采集不断补充标本馆的标本。将中国淡水鱼类物种、地理分布、基因序列等生物多样性信息集成在一个数据库中并与国际通用生物信息数据库的网络连接和查询。保持了淡水鱼类标本收藏亚洲第一的地位。保持了鲤形目鱼类系统发育研究在国内外的主导地位。探索进化生物学研究的新理论、新手段,积极参与国际竞争。大力投入水生生物标本馆及网络信息系统的的建设,使用网络和数字化技术加强对我所鱼类标本的管理,使生物标本这一国家战略性资源的管理和利用达到发达国家的中等水平。该组的前身“鱼类分类学科组”主要开展淡水鱼类的分类学研究工作。 该组具有悠久的历史和优良的传统,在国内外鱼类学界享有一定的知名度。它建立并维持了一个有40万号,1000余种淡水鱼类标本的、亚洲最大的标本馆。先后有伍献文、陈宜瑜、曹文宣研究员入选中国科学院院士。鱼类学学科组自建立以来,积极开展鱼类的基础和应用基础研究,在国内和国际都具有较高的知名度。在80年代初就在伍献文教授的倡导下,开展系统发育的理论和实践。对鲤形目、鲤科鱼类的系统发育研究在80年代引起国际鱼类学界的普遍关注;首次应用裂腹鱼物种分化模式探讨青藏高原的隆升过程。先后编辑出版了《中国鲤科鱼类志,上、下》、《中国动物志,鱼纲,鲤形目》上中下、《长江鱼类》、《中国淡水鱼类原色图集1、2、3》等重要的鱼类学著作。 该研究组具有广泛的国际联系与合作,与世界三大自然历史博物馆:大英博物馆、美国国家自然历史博物馆、法国国家自然历史博物馆分别就鱼类进化生物学开展多方的合作。除此之外,鱼类学研究室还与日本、韩国、俄罗斯、美国、法国、瑞典的鱼类学研究机构有着不同层次的合作研究。鱼类学研究室还积极开展海峡两岸的合作和联系,目前我们与台湾的以下学术机构建立了长期的合作关系:台湾中央研究院动物研究所、台湾清华大学生命科学系、台湾大学动物系、台湾东华大学、台湾海洋博物馆、国家公园学会等。 经过几代人的努力,该研究组已成为一个基础与应用并重,注重人才培养的淡水鱼类研究基地。具有一支精干的队伍,合理的人才结构。目前该研究室在鱼类学领域在我国起到了一个研究基地的作用。承担有国家863、973项目、国家自然科学重点基金各项基金和中国科学院的课题各级课题,研究范围涉及到理论和应用。研究室年轻一代的科研人员,在继承传统的同时,力求创新,不断探索最新的理论和方法在鱼类分类、系统进化、生物地理学的应用。 毕业学生:张燕硕士(Penn State Univ.博士研究生);杨雷(St, Louis Univ. 博士研究生);王伟博士(广州,军医大学);王绪桢博士(水生所,助理研究员);彭作刚博士(水生所,助理研究员).

仪器设备:Beckman冷冻离心机、BECKMAN 离心机、PCR仪(3台)、紫外分光光度计、电子天平、紫外凝胶分析系统、紫外透射仪、超净工作台、生化培养箱(2台)、高压灭菌锅、恒温摇床,电泳仪(3)、蛋白电泳仪、电子恒温水浴锅、蔡斯显微镜、蔡斯立体解剖镜、计算机工作站、苹果电脑(3台)。日本产软X光机(拍摄小型脊椎动物骨骼图片)

近三年发表文章:

 

In press

He, S., Mayden, R., Wang, X., Wang, W., Tang, K.L., Chen, Y. 2007. Molecular phylogenetics of the family Cyprinidae (Actinopterygii: Cypriniformes) as evidenced by sequence variation in the first intron of S7 ribosomal protein-coding gene: Further evidence from a nuclear gene of the systematic chaos in the family. Molecular Phylogenetics and Evolution.

Mayden, R., Tang, K.L., Conway, K.W., Freyhof, J., Chamberlain, S., Haskins, M., Schneider, L., Sudkamp, M., Wood, R.M., Agnew, M., Bufalino, A., Sulaiman, Z., Miya, M., Saitoh, K., and He, S. 2007. Phylogenetic relationships of Danio within the order Cypriniformes: A framework for comparative and evolutionary studies of a model species. Journal of Experimental Zoology (Mol Dev Evol).

 

2007年度

Guo, X., He, S., Zhang, Y., 2007. Phylogenetic relationships of the Chinese sisorid catfishes: A nuclear intron versus mitochondrial gene approach. Hydrobiologia, 579: 55-68.

Han, Y., He, S., 2007. Identifying novel SINEs elements from Cyprinidae and their proliferation mechanisms. Progress in Natural Science, 17: 270-279.

Huang, S., He, S., Peng, Z., Zhao, K., Zhao, E., 2007. Molecular phylogeography of endangered sharp-snouted pitviper (Deinagkistrodon acutus; Reptilia, Viperidae) in Mainland China. Molecular Phylogenetics and Evolution., 44: 942-952.

Kong, X., Wang, X., Gan X., He, S. 2007. The c-myc cDNA sequences of cyprinids (Teleostei: Cypriniformes): Implications for phylogeny. Chinese Science Bulletin, 52: 1491-1500.

Ku, X., Peng, Z., Diogo, R., He, S., 2007. MtDNA phylogeny provides evidence of generic polyphyleticism for East Asian bagrid catfishes. Hydrobiologia, 579: 147-159.

Luo, J., Stadler, P.F., He, S., Meyer, A., 2007. PCR survey of Hox genes in the goldfish Carassius auratus auratus. Journal of Experimental Zoology (Mol Dev Evol), 308: 250-258.

Peng, Z., Ludwig, A., Wang, D., Diogo, R., Wei, Q., He, S., 2007. Age and biogeography of major clades in sturgeons and paddlefishes (Pisces: Acipenseriformes). Molecular Phylogenetics and Evolution, 42: 854-862.

Wang, L., He, S., Chen, Y., 2007. Identification of the Angel-related elements in cyprinid fishes and their phylogenetic implications. Progress in Natural Science, 17: 168-171.

Wang, X., Li, J., He, S., 2007. Molecular evidence for the monophyly of East Asian groups of Cyprinidae (Teleostei: Cypriniformes) derived from the nuclear recombination activating gene 2 sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution, 42: 157-170.

Wang, X., Wang, J., He, S., Mayden, R., 2007. The complete mitochondrial genome of the Chinese hook snout carp Opsariichthys bidens (Actinopterygii: Cypriniformes) and an alternative pattern of mitogenomic evolution in vertebrate. Gene, 399: 11-9.

Zhao, K., Duan, Z., Yang, G., Peng, Z., He, S., Chen, Y., 2007. Origin of Gymnocypris przewalskii and phylogenetic history of Gymnocypris eckloni (Teleostei: Cyprinidae). Progress in Natural Science, 17: 520-528.

孔祥会, 王绪祯, 甘小妮, 何舜平. 2007. 鲤科鱼类的c-myc CDS 及其系统发育关系. 科学通报, 52: 1028-1036.

王莉, 何舜平, 陈宜瑜. 2007. 鲤科鱼类Angel相关元件的扩增与鉴定及其系统发育意义. 自然科学进展, 17: 542-545.

赵凯, 段子渊, 杨公社, 彭作刚, 何舜平, 陈宜瑜. 2007. 青海湖裸鲤的起源和花斑裸鲤的种群演化. 自然科学进展, 17: 320-328.

 

2006年度

Peng, Z., He, S., Wang, J., Wang, W., Diogo, R., 2006. Mitochondrial molecular clocks and the origin of the major Otocephalan clades (Pisces: Teleostei): A new insight. Gene, 370: 113-124.

Peng, Z., Ho, S.Y.W., Zhang, Y., He, S., 2006. Uplift of the Tibetan plateau: Evidence from divergence times of glyptosternoid catfishes. Molecular Phylogenetics and Evolution, 39: 568-572.

Peng, Z., Wang, J., He, S., 2006. The complete mitochondrial genome of the helmet catfish Cranoglanis bouderius (Siluriformes: Cranoglanididae) and the phylogeny of otophysan fishes. Gene, 376: 290-297.

Xu, H., Ding, H., Li, M., Qiang S., Guo, J., Han, Z., Huang, Z., Sun, H., He, S., Wu, H., Wan, F., 2006. The distribution and economic losses of alien species invasion to China. Biological Invasions, 8: 1495-1500.

Xu, H., Qiang, S., Han, Z., Guo, J., Huang, Z., Sun, H., He, S., Ding, H., Wu, H., Wan, F., 2006. The status and causes of alien species invasion in China. Biodiversity and Conservation, 15: 2893-2904.

Yang, J., He, S., Freyhof, J., Witte, K., Liu, H., 2006. The phylogenetic relationships of the Gobioninae (Teleostei: Cyprinidae) inferred from mitochondrial cytochrome b gene sequences. Hydrobiologia, 553: 255-266.

丁言伟, 彭作刚, 张训蒲, 何舜平. 2006. 黄颡鱼属(Pelteobagrus)两种鱼类的线粒体ND4基因序列变异性分析. 水生生物学报, 30(4): 413-419.

孔祥会, 何舜平. 2006. 鱼类物种特异的尺寸控制因素研究进展. 水生生物学报, 30(5): 614-620.

赵凯, 何舜平, 彭作刚, 李俊兵. 2006. 青海湖裸鲤的种群结构和线粒体DNA变异. 青海大学学报, 24 (4): 1-4.

赵凯, 杨公社, 李俊兵, 何舜平. 2006. 黄河裸裂尻鱼群体遗传结构和Cyt b序列变异. 水生生物学报, 30(2): 129-133.

 

2005年度

Guo, X., He, S., Zhang, Y., 2005. Phylogeny and biogeography of Chinese sisorid catfishes re-examined using mitochondrial cytochrome b and 16S rRNA gene sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution, 35: 344-362.

He, S., Wang, D., Wang, W., Chen, D., Zhao, Q., Gong, W., 2005. Genetic diversity in the Yangtze finless porpoise by RAPD analysis. High Technology Letter, 11: 207-210.

Li, J., Wang, X., He, S., Chen, Y., 2005. Phylogenetic studies of Chinese labeonine fishes (Teleostei:Cyprinidae) based on the mitochondrial 16S rRNA gene. Progress in Natural Science, 15:13-219.

Son, Y., He, S., 2005. Cobitis zhejiangensis, a new species from the Ling River, China (Teleostei: Cobitidae). Korean Journal of Ichthyology, 17: 236-240.

Wang, X., Liu, H., 2005. Phylogenetic relationships of the Chinese cyprinid genus Rhinogobio Bleeker (Teleostei: Cyprinidae) based on sequences of the mitochondrial DNA control region, with comments on character adaptations. Hydrobiologia, 532: 215-220.

Zhao, K., Li, J., Yang, G., Duan, Z., He, S., Chen, Y., 2005. Molecular phylogenetics of Gymnocypris (Teleostei: Cyprinidae) in LakeQinghai and adjacent drainages. Chinese Science Bulletin, 50:1325-1333.

Zheng, J., Xia, J., He, S., Wang, D., 2005. Population genetic structure of the Yangtze finless porpoise (Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis): Implications for management and conservation. Biochemical Genetics, 43: 307-320.

李俊兵, 王绪桢, 何舜平, 陈宜瑜. 2005. 16srRNA基因序列变异和中国野鯪亚科鱼类单系性研究. 自然科学进展, 15: 46-52.

刘彩霞, 彭作刚, 何舜平. 2005. 长臀鮠属鱼类多变量形态分析及物种有效性研究. 水生生物学报, 29(5): 507-512.

彭作刚, 张耀光, 何舜平, 陈宜瑜. 2005. 从细胞色素b基因序列变异分析中国鲇形目鱼类的系统发育.遗传学报, 32(2): 145-154.

赵凯, 李俊兵, 杨公社, 段子渊, 何舜平, 陈宜瑜. 2005. 青海湖及其相邻水系特有裸鲤属鱼类的分子系统发育. 科学通报, 50(3): 1348-1355.

 

2004年度

Chen,Y., Wang, Y., He, S., Zhu, Z., 2004. Cloning and sequencing of the growth hormone gene of large yellow croaker and its phylogenetic concerning. Biochemical Genetics, 42: 365-375.

He, S., Liu, H., Chen, Y., Kuwahara, M., Nakajima, T., Zhong, Y., 2004. Molecular phylogenetic relationships of Eastern Asian Cyprinidae (Pisces: Cypriniformes) inferred from cytochrome b sequences. Science in China, 47: 130-138.

Peng, Z., He, S., Zhang, Y., 2004. Phylogenetic relationships of glyptosternoid fishes (Siluriformes: Sisoridae) inferred from mitochondrial cytochrome b gene sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution, 31: 979-987.

Sun, Y., Liu, S., Zhao, G., He, S., Wu, Q., Taniguchi, N., Yu, Q., 2004. Genetic structure of Chinese sucker population Myxocyprinus asiaticus in the Yangtze River based on mitochondrial DNA marker. Fisheries Science, 70: 412-420.

Wang, X., Liu, H., He, S., Chen, Y., 2004. Sequence analysis of cytochrome b gene indicates that East Asian group of cyprinid subfamily Leuciscinae (Teleostei: Cyprinidae) evolved independently. Progress in Natural Science, 14: 132-137.

郭宪光, 张耀光, 何舜平. 2004. 中国石爬鮡属鱼类的形态变异及物种有效性研究. 水生生物学报, 28(3): 260-268.

何舜平, 刘焕章, 陈宜瑜, 中岛经夫, 桑原雅之, 钟杨. 2004. 基于细胞色素b基因序列的鲤科鱼类系统发育研究(鱼纲: 鲤形目). 中国科学, 34(1): 96-104.

 

2003年度

Zhang, E., He, S., Chen, Y., 2003. Revision of the cyprinid genus Placocheilus Wu, 1977 in China, with description of a new species from Yunnan. Hydrobiologia, 488: 1-11.

何舜平. 2003. 食人鱼. 生物学通报, 38(3): 5-7.

王伟李墨怡, 何舜平. 2003. 中国鮡科鱼类RAPD分析及鰋鮡鱼类单系性的初步研究. 水生生物学报, 27(1): 92-94.

王绪桢, 何舜平. 2003. S7核糖体蛋白基因序列变异与丹亚科鱼类单系性研究,水生生物学报, 27(2):122-126.

张燕, 张鹗, 何舜平. 2003. 中国鲿科鱼类线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析. 水生生物学报, 27(5): 463-467.

郑劲松, 何舜平, . 2003. 分子生物学方法在鲸类学研究中的应用. 水生生物学报, 27(3): 286-290.

 

2002年度

Peng, Z., He, S., Zhang, Y., 2002. Mitochondrial cytochrome b sequence variations and phylogeny of the East Asian bagrid catfishes. Progress in Natural Science, 12: 421-425.

Wang, W., He, S., Chen, Y., 2002. Mitochondrial d-loop sequence variation and phylogeny of gobiotine fishes. Progress in Natural Science, 12(11): 866-868.

Wang, X., He, S., Chen, Y., 2002. Sequence variations of the S7 ribosomal protein gene in primitive cyprinid fishes: implication on phylogenetic analysis. Chinese Science Bulletin, 47(19): 1638-1643.

彭作刚, 何舜平, 张耀光. 2002. 细胞色素b基因序列变异与东亚鲿科鱼类系统发育. 自然科学进展, 12(6): 596-600.

孙玉华, 王伟, 刘思阳, 何舜平等. 2002. 中国胭脂鱼线粒体控制区遗传多样性分析. 遗传学报, 29(9): 787-790.

王伟, 何舜平, 陈宜瑜. 2002. 线粒体DNA d-loop序列变异与鳅鮀亚科鱼类系统发育. 自然科学进展, 12(1): 33-36.

王绪桢, 何舜平, 陈宜瑜. 2002. S7核糖体蛋白基因序列变异几及其在低等鲤科鱼类中的系统发育意义. 科学通报, 47(14): 1089-1094.

王绪桢, 何舜平. 2002. 异鲴的骨骼形态及属的分类位置. 水生生物学报, 26(3): 253-258.

 

2001年度

Chen, Y., He, S., 2001. Freshwater fishes distribution in Taiwan and continent of China and its biogeographical significance. Progress in Natural Science, 11(6): 411-416.

He, S., Chen, Y., Nakajima, T., 2001. Sequences of cytochrome b gene for primitive cyprinid fishes in East Asia and their phylogenetic concerning. Chinese Science Bulletin, 46(8): 661-665.

He, S., Cao, W., Chen, Y., 2001. The uplift of Qinghai-Xizang (Plateau) and the Vicariance Speciation of Glyptosternoid fishes (Siluriformes: Sisoridae). Science in China, 44(6): 644-651.

Son, Y., He, S., 2001. Transfer of Cobitis laterimaculata to the genus Niwaella (Cobitidae). Korean Journal of Ichthyology. 13(1): 1-5.

陈宜瑜, 何舜平. 2001. 海峡两岸淡水鱼类分布格局及其生物地理学意义. 自然科学进展, 11(4): 337-342.

何舜平, 曹文宣, 陈宜瑜. 2001. 青藏高原的隆升与鰋鮡鱼类(鲇形目:鮡科)隔离分化的关系. 中国科学, 31(2): 185-192.

王伟, 何舜平, 中岛经夫. 2001. 日本产和中国产中华细鲫的RAPD分析. 水生生物学报, 25(4): 358-361.

王绪桢, 何舜平. 2001. 异鲴的形态及其属的分类地位. 水生生物学报, 26(3): 1-5.

谢仲桂, 张鹗, 何舜平. 2001. 应用形态度量学方法对中华纹胸鮡和福建纹胸鮡物种有效性的研究. 华中农业大学学报, 20(2): 169-172.

 

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